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INFO-F208

Introduction à la bioinformatique

année académique
2021-2022

Titulaire(s) du cours

Tom LENAERTS (Coordonnateur)

Crédits ECTS

5

Langue(s) d'enseignement

français

Contenu du cours

  1. Fondations moléculaire

  2. L'analyse des séquences par paires et la programmation dynamique

  3. La construction des matrices de substitution

  4. Les bases de données biologiques et SQL

  5. Cherchez les homologues dans des bases de données

  6. L'alignement de plusieurs séquences et les profils

  7. Des motifs et des modèles de Markov caché

  8. La construction de arbres phylogénétiques

  9. La prédiction des structures secondaires

Objectifs (et/ou acquis d'apprentissages spécifiques)

Étudier les méthodes informatiques qui étaient construites pour la résolution des question biologiques. Rendre les étudiants capables de comprendre les questions biologiques et les articles publiés sur ce sujet. En outre, les étudiants devraient être capable d'expliquer et reproduire certaines algorithmes. L'objectif secondaire est d'augmenter l'intérêt des étudiants pour des disciplines interdisciplinaires.

Pré-Requis

Cours pré-requis

Méthodes d'enseignement et activités d'apprentissages

exposés et 4 projets (guidance pendant les TP)

Références, bibliographie et lectures recommandées

Marketa Zvelebil and Jeremy O. Baum. Understanding Bioinformatics. Garland Science. ISBN 978-0-8153-4024-9

Autres renseignements

Contacts

Pr. Tom Lenaerts

co-Head of the Machine Learning Group

Département d'Informatique

Université Libre de Bruxelles

Boulevard du Triomphe CP 212

1050 Brussels

Belgium

Tel: 02/650.60.04 (secr. 02/650.59.14)

Fax: 02/650.56.09

Email:Tom.Lenaerts@ulb.ac.be

Web: http://www.ulb.ac.be/di/map/tlenaert/

Web: http://mlg.ulb.ac.be/

Campus

Plaine

Evaluation

Méthode(s) d'évaluation

  • Examen écrit
  • Rapport écrit
  • Portfolio

Les étudiants sont évalués sur la base des projets qu'ils réalisent au cours de l'année, du rapport dans lequel ils utilisent leurs propres outils et d'un examen en ligne.

Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles)

Le score est composé de  3 parties:
1. 35% pour le portfolio de projets 
2. 35% pour le rapport final
3. 30% pour l'examen en ligne (choix multiple)

Langue(s) d'évaluation

  • français

Programmes