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PROTEO-2.3 - Initiation pratique à la spectrométrie de masse en tandem

PROTEO-2.3 - Initiation pratique à la spectrométrie de masse en tandem

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  • Programme title
    PROTEO-2.3 - Initiation pratique à la spectrométrie de masse en tandem
  • Programme mnemonic
    FC-564
  • Programme organised by
    • Centre de Formation Continue en Santé et Sciences de la vie
    • Université libre de Bruxelles
  • Title type
    formation continue
  • Open to returning students
    yes
  • Languages of instruction
    french
  • Programme duration
    short (2 to 5 days)

Details

General information

Title type

formation continue

Programme duration

short (2 to 5 days)

Learning language(s)

french

Organising faculty(s) and university(ies) Open to returning students

yes

Presentation

Deux jours de pratique pour appréhender et expérimenter un protocole de spectométrie de masse en tandem de A à Z

  • 30 % pratique

  • 20 % démonstrations/visite labos

  • 50 % analyses de données/discussions

Calendar & registration

Prerequisites

Connaissances de base sur la spectrométrie de masse et l’HPLC/UPLC ou avoir suivi les modules PROTEO-1.1 « L’identification de peptides et de protéines par la spectrométrie de masse» et PROTEO-2.2 « La chromatographie liquide appliquée à la détection par spectrométrie de masse »

Calendar & registration

Programme

  • Préparation/pré-traitement des échantillons protéiques (digestion par protéase…)

  • Introduction à l’acquisition des données en mode dépendant (MS-MS/MS) - démonstration

  • Analyse des échantillons (protéine pure et mélange protéique) par spectrométrie de masse en tandem: séparation des peptides par UPLC - couplage de l’UPLC avec le spectromètre de masse et automatisation des analyses - analyse en ligne des peptides élués par spectrométrie de masse en tandem (Q-ToF et Ion Trap)

  • Analyse des spectres de fragmentation obtenus (séquençage de novo)

  • Analyses bioinformatiques afin d’identifier une protéine à partir des spectres de fragmentation obtenus - discussion critique des résultats obtenus

  • Identification de protéines à partir d’un mélange simple ET à partir d’un mélange complexe - discussion critique des résultats obtenus