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Introduction à l'épidémiologie spatiale et moléculaire
Titulaire(s) du cours
Simon DELLICOUR (Coordonnateur) et Marius GILBERTCrédits ECTS
5
Langue(s) d'enseignement
français
Contenu du cours
- Introduction générale à l’épidémiologie
- Introduction à la cartographie
- Analyses de données spatiales
- Introduction à l’épidémiologie spatiale
- Introduction aux modèles épidémiologiques
- Introduction à l’épidémiologie moléculaire
- Introduction à la phylodynamique
- Présentation de cas d'étude (grippe aviaire)
Objectifs (et/ou acquis d'apprentissages spécifiques)
- manipuler, visualiser et effectuer des analyses sur des données spatiales (de type raster et vectoriel)
- explorer la distribution de données épidémiologiques et effectuer des cartographies de risque
- effectuer des analyses exploratoires en épidémiologie moléculaire (comme des analyses phylogéographiques)
Pré-requis et Co-requis
Cours co-requis
Méthodes d'enseignement et activités d'apprentissages
Ce cours se veut orienté sur l’analyse de données. Un simulateur aura été utilisé par les enseignants pour simuler des épidémies inspirées de propagations virales d’actualité, telles que celles de la peste porcine africaine, du virus de la dengue, du virus H5N1 ou encore du virus Ébola. Les paramètres de simulation seront conservés mais non communiqués aux étudiant.e.s qui recevront en début de semestre des jeux de données simulés correspondant à des données réelles analysées au cours d’une épidémie. Chaque séance de cours débutera par deux heures lors desquelles une catégorie d’approches analytiques sera enseignée par les co-titulaires du cours, et/ou un.e intervenant.e extérieur.e dans le cadre de certaines séances de cours bénéficiant d’une expertise complémentaire. S’en suivront deux heures de travaux pratiques lors desquelles les étudiant.e.s auront l’opportunité d’appliquer ces approches par binôme sur « leur » jeu de données. L’objectif : apprendre à essorer ces jeux de données pour engendrer un maximum de compréhension sur le dynamique de propagation du virus et les facteurs externes impactant celle-ci.
Support(s) de cours
- Université virtuelle
Contribution au profil d'enseignement
Maîtriser, explorer et mobiliser un ensemble de connaissances scientifiques, techniques et technologiques avancées liées à l’ingénierie biologique et aux sciences agronomiques, applicables dans les régions tempérées et tropicales, sur la base des résultats de recherches de pointe dans les domaines de l'épidémiologie spatiale et moléculaire.
Analyser, diagnostiquer et modéliser des situations complexes liées aux sciences agronomiques en faisant preuve d’une démarche scientifique rigoureuse ainsi que d’un esprit critique et objectif : choisir des méthodes d’analyse statistique pertinentes, élaborer des modèles, interpréter les résultats et évaluer leur fiabilité de manière critique.
Agir en praticien réflexif et démontrer un ensemble de compétences transversales nécessaires au travail en équipe et à la gestion de projets multidisciplinaires : synthétiser, vulgariser et communiquer ses résultats de manière adaptée à ses interlocuteurs, oralement et par écrit, tant en français qu’en anglais.
Autres renseignements
Contacts
Simon Dellicour (simon.dellicour@ulb.be)
Campus
Plaine
Evaluation
Méthode(s) d'évaluation
- Examen oral
- Autre
Examen oral
Autre
L’évaluation du cours se fera par la remise d’un court rapport d’analyses qui sera ensuite défendu oralement par chaque binôme.
Langue(s) d'évaluation
- français