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GENO 3.3.2 / STAT 4.1 - Analyse de données RNA-seq avec le logiciel R
Accroche introductive
Utiliser le logiciel R pour traiter et analyser des données génomiques...
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Call to actions
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Intitulé du programmeGENO 3.3.2 / STAT 4.1 - Analyse de données RNA-seq avec le logiciel R
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mnémonique du programmeFC-682
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Programme organisé par
- Centre de Formation Continue en Santé et Sciences de la vie
- Université libre de Bruxelles
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Type de titreformation continue
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Accessible en reprise d'étudesoui
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Type d'horaireEn journée
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Durée de la formationcourte (2 à 5 jours)
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Catégorie / ThématiqueSciences et techniques - Sciences/Santé - Sciences biomédicales et pharmaceutiques/Santé - Sciences médicales/Santé - Sciences de la santé publique
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Complément
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E-mail de contact
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Téléphone de contact
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Renseignements supplémentaires
Présentation
Détails
Informations générales
Type de titreformation continue
Durée de la formationcourte (2 à 5 jours)
Type d'horaireEn journée
Catégorie(s) - Thématique(s)Sciences et techniques - Sciences/Santé - Sciences biomédicales et pharmaceutiques/Santé - Sciences médicales/Santé - Sciences de la santé publique
Faculté(s) et université(s) organisatrice(s) Accessible en reprise d'étudesoui
Tarifs- Doctorant ULB : 190 €
- Secteur public / ASBL : 270 €
- Entreprise : 380 €
Inscription
Vous faites partie du personnel ULB ? La formation pourrait correspond à votre parcours de carrière ? Contact : formations.drh@ulb.be
Intervenant & coordination
Intervenant
Matthieu Defrance PhD
Computer Science (Université de Lille)
Professeur (ULB) Senior Researcher at IB2
Coordination
Marie Lebacq
Biostatisticienne
Ingénieure de formation ULB HeLSci - BIOPS
Matthieu Defrance PhD
Computer Science (Université de Lille)
Professeur (ULB) Senior Researcher at IB2
Coordination
Marie Lebacq
Biostatisticienne
Ingénieure de formation ULB HeLSci - BIOPS
Contacts
Besoin d'aide pour vous inscrire, contactez-nous par téléphone ou envoyez-nous un email.
En découvrir plus sur https://biops.helsci.be/
Toute l'équipe de ULB HeLSci est à votre disposition !
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Présentation
Objectifs de la formation
Connaître les principales méthodes et outils d’analyse des données RNA-seq et pouvoir les mettre en œuvre avec le logiciel R.
Horaire
En journée
- 2 demi-journées de formation (ou 3 sessions de 3 heures si donnée à distance)
- De 9h à 13h et/ou de 13h à 17h
- Il est également possible que la formation se donne à distance. Dans ce cas, elle est donnée en 3 sessions de 3 heures, sur 3 journées différentes. Les tarifs restent identiques.
Calendrier & inscriptions
Pré-requis
- Avoir suivi le module STAT 1.1 Part I - Statistiques de base appliquées aux sciences du vivant (statistique descriptive & comparaison moyenne) ou connaissances équivalentes
- Avoir suivi le module STAT 2.1 Initiation au logiciel R ou connaissances équivalentes
Public ciblé
- Biologistes, responsables de projets, chercheurs du secteur biotechnologique qui sont amenés à réaliser des expériences de RNA-seq
- 12 personnes maximum
Calendrier & inscriptions
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BESOIN D'AIDE POUR VOUS INSCRIRE ?
-
Contactez-nous par téléphone au 02/555 85 19 ou envoyez-nous un email à l'adresse suivante biops@ulb.ac.be.
Toute l'équipe de ULB HeLSci est à votre disposition
Programme
PROGRAMME
1. Introduction générale
- Introduction à l’analyse de données NGS
- Présentation générale des outils d’analyse
2. RNA-SEQ
- Rappels sur l’ARN et l’expression
- Design expérimental, questions biologiques et contraintes en terme d’analyse
- Protocole expérimental RNA-seq
- Notions de statistiques essentielles pour les analyses de données de séquences RNA-seq
3. Analyse de données RNA-SEQ
- Alignement des lectures (reads) sur un génome de référence (algorithmes et outils)
- Quantification de l’expression, visualisation et détection des anomalies
- Expression différentielle et interprétation des résultats
A. En pratique - RNA-seq : des reads à la quantification de l’expression
B. En pratique - RNA-seq : expression différentielle
MÉTHODOLOGIE
- 60% de théorie
- 40% de pratique