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Biologie Structurale, Enzymologie et Protéomie
Titulaire(s) du cours
Abel GARCIA PINO (Coordonnateur) et Sabrina BOUSBATACrédits ECTS
5
Langue(s) d'enseignement
français
Contenu du cours
Early history and basic concepts in structural biology. Novel techniques and single molecule approaches and how have they changed our understanding of how macromolecular molecular systems work.
Enzymologie
Rappels de cinétique chimique; description cinétique des réactions enzymatiques; détermination des paramètres cinétiques; types de catalyse; thermodynamique des réactions enzymatiques; stabilisation de l'état de transition par les enzymes; inhibition de l'activité enzymatique; enzymes allostériques; adaptation des enzymes aux conditions extrêmes.
Protéomique
Le séquençage des génomes et en particulier celui de l’homme a permis à de nouvelles techniques dites post-génomique de se développer dont la protéomique. Le but étant de comprendre comment les produits de ces génomes, les protéines, fonctionnent dans un organisme. La première partie du cours abordera les méthodes actuelles utilisées pour analyser et identifier les protéines. La deuxième partie traitera des applications tirées de la littérature scientifique. Finalement, les performances et les limitations de la protéomique seront discutées.
Objectifs (et/ou acquis d'apprentissages spécifiques)
State of the art in Structural Biology, what can you do and what can learn from looking at macromolecules at high resolution.
Enzymologie
Formation destinée à illustrer les apports de disciplines scientifiques telles que la biochimie et la biologie moléculaire à l'enzymologie moderne. À l'issue du cours, l'étudiant doit être capable d'appréhender les nouvelles approches de l'enzymologie.
Protéomique
Etat de l’art de la protéomique et son utilisation pour résoudre des questions biologiques.
Pré-requis et Co-requis
Connaissances et compétences pré-requises ou co-requises
Structural Biology
General principles of biochemistry
Enzymologie
Notions générales de biochimie
Protéomique
Les notions générales de la chimie des protéines.
Méthodes d'enseignement et activités d'apprentissages
Structural Biology
Lectures (slide shows)
Two sessions of practical exercises for the analysis of structural biology data.
Enzymologie
Cours magistral illustré (diaporama).
Protéomique
Cours magistral illustré (diaporama).
Deux séances d’exercices sur l’analyse des données de spectrométrie de masse.
Références, bibliographie et lectures recommandées
Structural Biology
Introduction to Structural Biology (Carl Branden & John Tooze)
Lehninger Principles of Biochemistry (David L. Nelson & Michael M. Cox)
Structure and Mechanisms in Protein Science (Alan Fersh)
Enzymologie
Fundamentals of Enzyme Kinetics, A. Cornish-Bowden, Wiley-Blackwell.
Enzyme Kinetics and Mechanism, P.F. Cook and W.W. Cleland, Garland Science - Taylor and Francis Group.
Protéomique
Copie des diapositives projetées lors du cours (disponibles via Université Virtuelle) ainsi que des articles proposés lors du cours.
Support(s) de cours
- Université virtuelle
Contribution au profil d'enseignement
Structural Biology
Introduction to concepts in structural biology, how macromolecules “work” and the structure/function paradigm.
Enzymologie
S'approprier les concepts scientifiques et les connaissances fondamentales de l'enzymologie. Appréhender l’évolution des connaissances sur un sujet donné.
Protéomique
Se familiariser avec les concepts de biologie à grande échelle.
Autres renseignements
Contacts
Abel Garcia-Pino : abel.garcia.pino@ulb.be
Louis Droogmans : louis.droogmans@ulb.be
Sabrina Bousbata : sabrina.bousbata@ulb.be
Campus
Plaine
Evaluation
Méthode(s) d'évaluation
- Examen oral
Examen oral
Structural Biology
Oral exam based course’s lectures and a discussion of a paper that will be provided ahead of the exam.
Enzymologie
Les acquis en enzymologie seront évalués sur base d'un examen oral en session.
Protéomique
L'examen est basé sur un examen oral indépendant pour chaque partie et portant sur le cours magistral et le rapport des séances d’exercices.
Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles)
La réussite de l’unité d'enseignement est conditionnée à la réussite (moyenne supérieure ou égale à 10/20) de chacune des trois activités d’enseignement qui la composent (Biologie structurale, Enzymologie et Protéomique) qui contribueront pour respectivement 30%, 40% et 30% à la note finale de l'unité d'enseignement. En cas de note d’activité d’enseignement inférieure à 10/20, la note finale de l’unité d’enseignement est la note la plus basse des trois activités d’enseignement. La note de Protéomique se composera à 75% de la note de l'examen oral et à 25% de la note des exercices. La note finale ainsi que les notes des différentes activités d’enseignement seront communiquées en fin de session.
La présence aux exercices est obligatoire; elle conditionne la réussite de l'étudiant pour l'unité d'enseignement. Un étudiant non présent aux séances d’exercices sera noté ABSENT comme cote globale tant pour la première que la seconde session.
Langue(s) d'évaluation
- anglais
- français