Biologie Structurale, Enzymologie et Protéomie

Structural Biology
Early history and basic concepts in structural biology. Novel techniques and single molecule approaches and how have they changed our understanding of how macromolecular molecular systems work.

Enzymologie
Review concepts on chemical kinetics; kinetic description of enzymatic reactions; determination of kinetic parameters; types of catalysis; thermodynamics of enzymatic reactions; stabilization of the transition state by enzymes; inhibition of enzymatic activity; allosteric enzymes; adaptation of enzymes to extreme conditions.

Protéomique
Le séquençage des génomes et en particulier celui de l’homme a permis à de nouvelles techniques dites post-génomique de se développer dont la protéomique. Le but étant de comprendre comment les produits de ces génomes, les protéines, fonctionnent dans un organisme. La première partie du cours abordera les méthodes actuelles utilisées pour analyser et identifier les protéines. La deuxième partie traitera des applications tirées de la littérature scientifique. Finalement, les performances et les limitations de la protéomique seront discutées.

Structural Biology
State of the art in Structural Biology, what can you do and what can learn from looking at macromolecules at high resolution.

Enzymologie
The course is designed to illustrate the contributions of scientific disciplines such as biochemistry and molecular biology to modern enzymology. At the end of the course, the student should be able to understand the new approaches in enzymology.

Protéomique
Etat de l’art de la protéomique et son utilisation pour résoudre des questions biologiques.

Connaissances et compétences pré-requises ou co-requises

Structural Biology
General principles of biochemistry

Enzymologie
General principles of biochemistry
Protéomique
Les notions générales de la chimie des protéines.

Structural Biology
Lectures (slide shows)


Enzymologie
Lectures (slide shows). In addition the students will form three groups to present one theme related with modern enzymology (each theme will be based on a specific paper). This activity is mandatory for the course. During the first class, the professor will provide instructions regarding the articles in order to show what is expected.

Protéomique
Cours magistral illustré (diaporama).
Deux séances d’exercices sur l’analyse des données de spectrométrie de masse.

Références, bibliographie et lectures recommandées

Structural Biology
Introduction to Structural Biology (Carl Branden & John Tooze)
Lehninger Principles of Biochemistry (David L. Nelson & Michael M. Cox)
Structure and Mechanisms in Protein Science (Alan Fersh)

Enzymologie
Fundamentals of Enzyme Kinetics, A. Cornish-Bowden, Wiley-Blackwell.
Enzyme Kinetics and Mechanism, P.F. Cook and W.W. Cleland, Garland Science - Taylor and Francis Group.

Protéomique
Copie des diapositives projetées lors du cours (disponibles via Université Virtuelle) ainsi que des articles proposés lors du cours.

Support(s) de cours

• Université virtuelle

Contacts

Abel Garcia-Pino : abel.garcia.pino@ulb.be
Sabrina Bousbata : sabrina.bousbata@ulb.be

Campus

Plaine

Méthode(s) d'évaluation

• Examen oral

Examen oral

Structural Biology and Enzymology parts
The exams for Parts 1 and 2 (Structural Biology and Enzymology) will be combined into a single oral exam based on the course lectures and the discussion of a research article that will be provided in advance. During the exam, the student will briefly introduce the article (5–10 minutes), followed by a discussion of the general concepts covered in both parts of the course in the context of the article.

Protéomique
L'examen est basé sur un examen oral indépendant pour chaque partie et portant sur le cours magistral et le rapport des séances d’exercices.

Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles)

La réussite de l’unité d'enseignement est conditionnée à la réussite (moyenne supérieure ou égale à 10/20) de chacune des trois activités d’enseignement qui la composent (Biologie structurale, Enzymologie et Protéomique) qui contribueront pour respectivement 30%, 40% et 30% à la note finale de l'unité d'enseignement. En cas de note d’activité d’enseignement inférieure à 10/20, la note finale de l’unité d’enseignement est la note la plus basse des trois activités d’enseignement. La note de Protéomique se composera à 75% de la note de l'examen oral et à 25% de la note des exercices. La note finale ainsi que les notes des différentes activités d’enseignement seront communiquées en fin de session.
La présence aux exercices est obligatoire; elle conditionne la réussite de l'étudiant pour l'unité d'enseignement. Un étudiant non présent aux séances d’exercices sera noté ABSENT comme cote globale tant pour la première que la seconde session.

Langue(s) d'évaluation

• anglais
• français