année académique
2024-2025
2025-2026

Titulaire(s) du cours

Olivier Delgrange (Coordonnateur) et Jérôme Delroisse

Crédits ECTS

2

Langue(s) d'enseignement

français

Contenu du cours

Cours théoriques (50%)

  • Introduction générale : Réalité mathématique VS réalité biologique
  • Séquences biologiques, Bases de données…
  • Alignements de séquences
  • Comment "interroger" les banques de données publiques
  • Méthodes de séquençages de nouvelle(s) génération(s) (NGS)
  • Transcriptome & Génome
  • Applications pratiques & Questionnements du biologiste

Sessions pratiques & exercices (50%)

  • Recherche de séquences, notion d'homologie de séquences, annotations fonctionnelles (Outils en ligne: NCBI, Expasy, plateforme Galaxy,...)
  • Analyse de l’expression différentielle à partir de données RNA-Seq & Visualisation des données d’expression (Outils en ligne: plateforme Galaxy, Degust, MetaboAnalyst)
  • Visualisation de données génomiques à l’aide d’un Genome Browser (IGV, serveurs en ligne)

Objectifs (et/ou acquis d'apprentissages spécifiques)

Le cours vise à initier les étudiants à la bioinformatique afin qu'ils puissent comprendre les notions de bases du domaine ainsi que les différentes méthodes abordées dans les publications scientifiques. En parallèle, les sessions pratiques permettront d'envisager concrètement des analyses bioinformatiques liées aux recherches et annotations de séquences, à l'expression différentielle à partir de données transcriptomiques ou à la visualisation de données génomiques sur un GenomeBrowser.

Pré-requis et Co-requis

Connaissances et compétences pré-requises ou co-requises

Notions de biochimie et de biologie moléculaire; manipulation d'un ordinateur personnel et d'Internet.

Méthodes d'enseignement et activités d'apprentissages

Cours magistraux (50%)
Sessions pratiques en salle informatique (50%)

Support(s) de cours

  • Université virtuelle

Autres renseignements

Informations complémentaires

Theoretical courses: UMONS, Campus de la plaine (co-modal teaching)
Practical sessions: UMONS, Campus de la plaine (presential teaching)

« Université Virtuelle »
Course materials available on Moodle

Contacts

Jérôme Delroisse

Campus

UMons

Evaluation

Méthode(s) d'évaluation

  • Examen oral

Examen oral

Construction de la note (en ce compris, la pondération des notes partielles)

Examen oral 80%
Participation active aux sessions pratiques 20%

Langue(s) d'évaluation

  • français
  • (éventuellement anglais )

Programmes